崔各庄村成村于明代，成村初崔姓居多，故以姓氏得村名。新中国建立前，崔各庄村属河北省顺义县。1950年初，崔各庄村建立党支部，隶属通县三区。1952年，改属通县九区。1956年3月，划归北京市东郊区孙河乡。1958年11月，崔各庄村改建为崔各庄生产队，隶属朝阳人民公社东郊站。1959年4月，隶属朝阳人民公社崔各庄管理站。同年11月，隶属和平人民公社万亩丰产方大队。1961年6月，隶属中阿友好人民公社崔各庄大队。1965年，隶属中阿友好人民公社崔各庄管理区。1968年，成立崔各庄生产队革命委员会。1974年，崔各庄生产队改建为崔各庄大队，隶属中阿友好人民公社。直至1978年底，大队的规模和隶属关系均未改变。

     60年代，崔各庄大队开始试种水稻，70年代盛产稻谷，亩产超千斤，号称“中阿公社的北大仓”，先后曾有中国农业科学院小麦专家张景希、著名无产阶级教育家徐特立，以及时任国务院副总理兼北京市革委会主任的谢富治亲临崔各庄指导、视察水稻种植。阿尔巴尼亚的考察团也曾来此参观水稻种植。

     60年代中期以后，崔各庄开始走工农并举的道路，兴建纸品加工厂，各生产队也积极开办各种副业，并在农闲时组织劳动力外务输出，如到国营878厂、南湖渠酒厂等做工，对集体经济的发展起到了促进作用。

   1958年11月，崔各庄村改建为崔各庄生产队.1968年，成立崔各庄生产队革命委员会。1974年，撤销崔各庄管理区，崔各庄生产队改建为崔各庄大队。

   1978年，崔各庄大队隶属中阿友好人民公社。1984年3月，崔各庄村选举产生了第一届村民委员会，同时设立党支部，隶属朝阳区崔各庄乡。1993年，撤销生产大队建制，成立农工商合作社。2009年5月，选举产生崔各庄村第一届经济合作社。2010年，村域面积1.74平方公里，全村共有961户，1849人。村设立党支部，有党员53人。

   随着改革开放的不断深入，在招商引资、筑巢引凤等政策的影响和号召下，崔各庄村凭借自身的区位优势，以出租厂房、租赁土地的方式吸引了匹比包装、圣象木业等多家外来企业落户此地，不仅促进了集体经济的发展，更解决了一部分村民的就业问题。

   崔各庄村历来重视文化体育活动的开展，2006年底成立了崔各庄村文化协会，包含秧歌、腰鼓、小车会、中幡、硬气功等多种丰富的民间传统娱乐项目，受到广大村民的热烈欢迎，崔各庄村的精神文明建设也由此推向了新的高峰。

随着朝阳区农村城市化进程的推进，崔各庄村于2010年9月已完成腾退搬迁。2009年，崔各庄村实现经济总收入6288.1万元，实现利润386.2万元，税金171.9万元，人均劳动所得14490.4元。